Калькулятор молекулярной массы белка

Автор: Henrick Yau
- July 21, 2026
| |

Калькулятор молекулярной массы белка

0
Допустимо

Молекулярная масса белка рассчитывается как сумма средних изотопных масс его аминокислотных остатков:

\[ MW = \sum (n_i \times MW_i) - (n_{пептид} \times MW_{H_2O}) \]

Где:

  • \(n_i\) = Количество каждой аминокислоты в последовательности
  • \(MW_i\) = Молекулярная масса каждой аминокислоты
  • \(n_{пептид}\) = Общее количество пептидных связей
  • \(MW_{H_2O}\) = Молекулярная масса молекулы воды (18,02 Да)

Что такое калькулятор молекулярной массы белка?

Калькулятор молекулярной массы белка помогает определить молекулярную массу белка на основе его аминокислотной последовательности или состава. Он также рассчитывает дополнительные свойства, такие как теоретическая изоэлектрическая точка (pI), коэффициент экстинкции, гидрофобность (GRAVY-индекс) и чистый заряд при pH 7.

Как использовать калькулятор

Калькулятор предлагает несколько способов ввода данных о белке:

  • Метод последовательности: Введите последовательность белка, используя однобуквенные коды аминокислот.
  • Метод состава: Вручную укажите количество каждой аминокислоты.
  • Расширенные опции: Примените модификации, такие как ацетилирование, дисульфидные связи или концевые модификации.

Ключевые возможности

  • Рассчитывает молекулярную массу как в дальтонах (Да), так и в килодальтонах (кДа).
  • Определяет теоретическую pI на основе значений pKa аминокислот.
  • Вычисляет коэффициент экстинкции для УФ-поглощения при 280 нм.
  • Оценивает гидрофобность с помощью GRAVY-индекса.
  • Учитывает пользовательские модификации, такие как фосфорилирование, метилирование и амидирование.

Почему важна молекулярная масса белка?

Знание молекулярной массы белка необходимо для:

  • Электрофоретического анализа (SDS-PAGE, вестерн-блоттинг).
  • Идентификации с помощью масс-спектрометрии.
  • Очистки белка и хроматографии.
  • Структурных и функциональных исследований.

Часто задаваемые вопросы

Как рассчитывается теоретическая pI?

Изоэлектрическая точка (pI) — это pH, при котором белок не имеет чистого заряда. Она рассчитывается с использованием уравнения Хендерсона-Хассельбаха:

\[ pI = \frac{pKa_{пол} + pKa_{отр}}{2} \]

Что такое коэффициент экстинкции?

Коэффициент экстинкции рассчитывается на основе количества остатков триптофана (W), тирозина (Y) и цистина (C):

\[ \varepsilon = (n_W \times 5500) + (n_Y \times 1490) + (n_C \times 125) \]

Как калькулятор обрабатывает модификации?

Калькулятор позволяет применять различные посттрансляционные модификации, которые добавляются или вычитаются из молекулярной массы белка.

Что такое GRAVY-индекс?

GRAVY-индекс (Grand Average of Hydropathy) — это мера гидрофобности белка. Он рассчитывается как:

\[ GRAVY = \frac{\sum (Гидропатия_{АК} \times n_{АК})}{Всего\ аминокислот} \]

Почему в расчетах учитывается молекула воды?

Каждое образование пептидной связи приводит к потере одной молекулы воды, поэтому общая масса корректируется соответствующим образом.

Заключение

Калькулятор молекулярной массы белка — это ценный инструмент для исследователей и студентов в области биохимии и молекулярной биологии. Будь то анализ структуры белка, проведение экспериментов или интерпретация результатов, этот инструмент быстро и точно предоставляет основные молекулярные свойства.